Der Verbandsrat setzt sich aus insgesamt 11 Mitgliedern zusammen. Als „geborene“ Mitglieder gehören dem Verbandsrat ebenfalls die fünf Dekane aus den Dekanatsbezirken mit bisheriger Trägerschaft einer Verwaltungseinrichtung an. Darüber hinaus werden sechs Mitglieder aus der Verbandsversammlung in den Verbandsrat gewählt, davon mindestens drei Ehrenamtliche. Der Verbandsrat ist ein wichtiges Organ des Zweckverbandes, das mehrmals jährlich tagt und die Interessen der Kirchengemeinden und Dekanatsbezirke vertritt. Das Gremium entscheidet u.a. über die Wirtschafts- und Stellenplanung sowie Personalangelegenheiten des Zweckverbandes und trifft wichtige strategische Entscheidungen gemeinsam mit der Geschäftsleitung.